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GROMACS: High performance molecular simulations through multi-level parallelism from laptops to supercomputers

机译：GROmaCs：通过从笔记本电脑到超级计算机的多级并行性进行高性能分子模拟

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Mark James Abraham; Teemu Murtola; Roland Schulz; Szilárd Páll; Jeremy C. Smith; Berk Hess; Erik Lindahl;
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年度 2015
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1. GROMACS: High performance molecular simulations through multi-level parallelism from laptops to supercomputers [J] . Mark James Abraham, Teemu Murtola, Roland Schulz, SoftwareX . 2015,第1期

机译：GROMACS：通过从笔记本电脑到超级计算机的多级并行，进行高性能分子模拟
2. MkVsites: A tool for creating GROMACS virtual sites parameters to increase performance in all-atom molecular dynamics simulations [J] . Journal of Computational Chemistry: Organic, Inorganic, Physical, Biological . 2020,第15a16期

机译：MKVSITES：用于创建Gromacs虚拟站点参数的工具，以提高全原子分子动力学模拟中的性能
3. Ion permeation simulations by Gromacs-an example of high performance molecular dynamics [J] . J. Krueger, G. Fels Concurrency, practice and experience . 2011,第3期

机译：Gromacs进行的离子渗透模拟-高性能分子动力学的一个例子
4. Large-Scale Molecular Dynamics Simulations on Modular Supercomputer Architecture with Gromacs [C] . S. Markov, P. Petkov, V. Pavlov International Conference on High Performance Computing . 2021

机译：Gromacs模块化超级计算机建筑的大规模分子动力学模拟
5. Dynamic Parallelism in GPU Optimized Barnes Hut Trees for Molecular Dynamics Simulations [D] . Carranza Zuniga, Melisa 2017

机译：GPU优化的Barnes小屋树中的动态并行性，用于分子动力学仿真
6. From laptops to supercomputers: a single highly scalable code base for spiking neuronal network simulations [O] . Susanne Kunkel, Maximilian Schmidt, Jochen M Eppler, 2013

机译：从笔记本电脑到超级计算机：单个高度可扩展的代码库用于增强神经网络仿真
7. GROMACS: High performance molecular simulations through multi-level parallelism from laptops to supercomputers [O] . Abraham Mark James, Murtola Teemu, Schulz Roland, 2015

机译：GROMACS：通过从笔记本电脑到超级计算机的多级并行性，进行高性能分子模拟

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